巴尔巴兽

企图引发数码世界革命的魔王型数码兽。控诉持续被人类随心所欲杀害的数码兽的不幸，为了从人类的暴行中守护数码兽的未来而诉求革命的必要性。为了让拥有使世界新生的力量的NEO诞生于是强夺系统界，进而希望得到散落在世界各地的「数码记忆体」。
是黑暗的数码记忆体拥有者。另外，为了抹杀妨碍自己的剑他们，派出了各种各样的手下。
与世界树交涉的结果是，与承认了巴尔巴兽想法的世界树一体化，化作神成为主计算机。不过，因为世界树把良心送往了人类世界只剩下一副外壳，因此性格继承了魔王巴尔巴兽。被胜利暴龙兽打败，在临死之际，加上黑暗的数码记忆体，让自己与全部黑暗区域的数据注入给NEO让其诞生。

华原翔（華原ショウ，Kahara Shou）

剑的发小。拥有黑色数码兽迷你，后变化为黑色数码器iC。是黑客驯兽师·骑士的真实身份。指责人类残酷驱使数码兽的行为，希望让现在的数码世界解体，创造一个新的数码世界，经过战斗为了帮助诺伦而成为剑他们的伙伴。

啄木鸟兽

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  啄木鸟兽
  骑士（翔）忠实的搭档数码兽。胸前有六角形的图案（Mu端口）。可以使用变异种特有的障壁（Protect）。另外是鸟之数码记忆体的拥有者。

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  八咫乌兽
  啄木鸟兽由骑士（翔）的数码之魂进化后的样子。拥有背部森林一瞬间毁灭的力力量。

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  渡鸦兽
  八咫乌兽因为翔的爆裂冲入进一步进化的数码兽。

美树原诺伦（美樹原ノルン，Mikihara Norn）

翔藏在巴尔巴兽城的神秘少女。身着哥德萝莉服装（拘束具）。 与剑、勇、亚美、翔在小时候见过面。那个时候，她向他们询问数码兽是什么。在知道了他们各自心中所想的重要事情后，拜托他们在数码兽的危机来临时战斗。 实际上是世界树的良心，作为世界树的另一个主计算机。成为了与世界树一体化后巴尔巴兽的影子一样的存在。巴尔巴兽被打倒后，拘束具解除自己成为神。

世界树

担负着数码世界的「神」。 对人类与数码兽的关系十分烦恼，将诺伦（良心）送入人类世界后，没有良心的空壳与巴尔巴兽的理想一致并与其一体化。与良心分离前，为了预防自己失控，留下了可以创造出拥有抑制神之力量的「调停者」的对神器。

NEO

引发数码世界革命的关键。巴尔巴兽所说的「次世代的超数码兽」，实际上是超越数码怪兽定义的「未来」的事物。 就连「調停者」的力量不及的存在。NEO所要实行的新世界创造是，抹掉一切可能引起纷争与悲剧的生命。世界的注销与创造成为可能，与其他的数码兽划清了界限。 其身体由数码记忆体构成，由「圣」的红发、「水」的触觉、「虫·草木」的荆棘、「机械·变异」的左臂、「鸟」的翅膀、「黑暗」的身体、「兽」的足、「龙」的右臂组成。

删除部队

执行巴尔巴兽命令的军团。其成员均残忍无情，受伤无法战斗的成员将会被删除（杀死）。巴尔巴兽被铲除后，迫于NEO的威胁，为了守护世界火速赶来参加最终决战。

• 炸弹兽：被认为是从投射兽上投下的炸弹使用。
• 导弹兽：战斗时将炸弹兽投下。除此之外还担任运输任务。
• 突击龙兽：删除部队的成员。最一般的士兵数量众多。听说NEO要让世界Reset后，开始支持剑他们。
• 海豹龙兽：从100位突击龙兽中选拔出的精英士兵。
• 坦克龙兽：装备战车火力与装甲的完全体。
• 幻蜂兽：胡蜂兽的部下。虽然量大但基本被亚古兽全歼了。
• 胡峰兽：一直管理着将来成为删除部队的数码蛋的成熟期数码兽。
• 炮蜂兽：上述的胡峰兽进化后的完全体，DP3600。擅长远距离的狙击，另外也存在能够搭载无数士兵的航母型。
• 纳米兽：化身天女兽想要夺走剑他们的数码记忆体，不过因为比兹兽进化的海天使兽的力量失去战斗意志而败北。
• 齿轮兽：纳米兽的部下们。装扮成了迪路兽。
• 木乃伊兽：追赶乘坐最新型电车兽的剑他们的删除部队。被用黑暗数码之魂（黑暗斗气）化作病毒种的加奥加兽大卸八块。

删除部队三将军

效命于巴尔巴兽的拥有屈指可数实力的将军，均为究极体。

• 斩马兽：堂堂正正的武士。轻易击倒大地暴龙兽，对于剑他们不放弃感到十分困惑。
• 混沌龙兽：好战且残忍的性格。粗野粗暴的言行，提议并实行对光之城围追堵截的二面作战。
• 毛莫兽：三将军的最后一位。彬彬有礼的言谈举止，理智且理性。被承认是巴尔巴兽唯一的「同志」。

透（トオル，Tooru）

剑的同学，教会剑玩战斗终端。很翔关系也很要好。

斋藤（サイトー，Saitou）

27岁，与剑首战的驯兽师。虽然带着比平均大小大将近10倍的暴龙兽，不过还是被剑的暴龙兽打败。之前还保持了30胜，应该不是弱小的驯兽师。以V-Jump杂志社的编辑为原型。

近藤（コンドー，Kondou）

斋藤的师父，搭档是烂泥兽。烂泥兽在与剑的比赛开始前一刻被突然出现的骑士的搭档啄木鸟兽一击消灭掉。此人物也是以V-Jump杂志社的主编为原型。

小妖精兽

神秘黑斗篷的真面目，住在数码世界的传说中的贤者，拥有圣之数码记忆体。将剑和即将消失的暴龙兽传送走。因为只有脸，被剑称作「大脸兽（顔だけモン）」（被认为在作者的前作《未確認少年ゲドー》也有反映）。因为海豹龙兽的攻击身负重伤，圣之数码记忆体也被夺走。

机械人兽

另一位贤者、光之城的指挥官，拥有机械变异的数码记忆体。拥有将同是完全体的坦克龙兽一个一个清除的实力。但是被混沌龙兽的超∞大炮击中受到致命伤，将自己的力量托付给勇后死去。但是，向数码记忆体中放入信息，并在数码记忆体中对付病毒，死后也很活跃。

阿特拉独角仙兽

北部森林之王，以完全体最高级防御力著称，DP在5000左右。拥有虫·草木的数码记忆体，被翔和八咫乌兽打败。其象征的角，作为战利品被带回到巴尔巴兽城。在最终决战中，死了还在NEO的体内支持剑他们。

电车兽

剑他们为了要在数码世界移动而乘坐的数码兽。紧急时刻可以变形为战斗形态。因为删除部队的攻击而负伤，将勇他们送到光之城，感谢一行人之后便死去。

向日葵兽

统帅植物系数码兽商队的首领。与剑他们共同前往北部森林，停留在了被破坏的森林残骸处。

火焰兽

被黑色数码核操纵的数码兽。将植物系数码兽们的草原烧尽变为了沙漠。DP950。没有实体因此不擅长物理攻击，通过进一步吸收火焰提升DP让大地暴龙兽陷入苦战。