数码兽最前线 Digimon Frontier
剧情梗概
游戏开始！数码世界之旅
拓也在弟弟信也生日这天收到了一封电子邮件，告诉了他「决定未来的游戏」开始了。按照邮件的指示，拓也从涩谷站底下乘上了电车，在车上他遇到了收到同样邮件的泉、友树和纯平。电车行驶的目的地是数码兽们居住的数码世界。在炎之终端，拓也他们遭到了刻耳柏洛兽的袭击，无意之中拓也发现了传说中的十斗士的斗士之魂。拓也凭借斗士之魂的力量，进化成了炎之斗士阿耆尼兽。
目前的数码世界，由于智天使兽的魔力，被染上邪恶的数码兽们大肆暴乱，很多大地的数据被夺走。拓也他们首先按照邮件的指示，前往「森林终端」。在旅途中，友树、泉、纯平分别得到斗士之魂进化成冰之斗士冰熊兽、风之斗士仙女兽、雷之斗士电光兽。另一方面，与拓也他们分头行动的少年辉二也获得了斗士之魂进化成了光之斗士野狼兽。
五人最终在贝壳鼻涕兽村子重逢，但是此时袭击村子的数码兽也是十斗士之一——侍奉智天使兽的土之十斗士洞穴兽。他使用拓也他们没有的兽型斗士之魂进化成巨人兽。在其力量面前，拓也他们败北，村子的数据被夺走。
仙女兽和冰熊兽的斗士之魂也暂时被夺走，大家陷入了危机。但随着辉二和拓也获得兽型斗士之魂并分别进化成加鲁姆兽和布利陀罗兽，孩子们开始反击。拓也抑制住布利陀罗兽的野性，终于成功反杀巨人兽并扫描了其兽型斗士之魂。
登场数码兽
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刻耳柏洛兽
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蜡烛兽
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金刚杵兽
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贝壳鼻涕兽
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熊猫兽
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玩具亚古兽
强敌邪恶五斗士！用兽型斗士之魂应对！
拓也他们在森林终端接收指示前往了炽天使兽城堡，他们从炽天使兽那里得知了数码世界目前的事态，然而此时恶之斗士突然出现。炽天使被被水银兽设计打败，拓也他们抱着炽天使兽留下的数码蛋逃离了城堡。
纯平用兽型斗士之魂进化成雷光兽打倒了追来的洞穴兽，泉进化成舒兹兽击退了拉娜兽。友树在秋叶市场得到兽型斗士之魂进化成暴雪兽从花龙兽手中守护了同伴。收集到所有斗士之魂的拓也他们接下来收到了前往「玫瑰明星」的指示。
拓也他们终于踏足暗之大陆，面对来袭的花龙兽，全员齐心协力经过苦战将其击破。但是接下来出现的暗之斗士幽暗兽是连兽型攻击和联合招数都不管用的可怕对手。为了掩护阿耆尼兽，加鲁姆兽也在幽暗兽的剑前倒下了。
狼狈不堪的拓也不知不觉来到了暗之终端，抛下一切回到人类世界。此刻正是他离家前的时间，看着过去的自己，拓也想起了在数码世界战斗的同伴们。在克服了对幽暗兽的恐惧之后返回了数码世界，此时的数码世界，泉、纯平、友树被五花大绑，辉二也陷入了与水银兽和拉娜兽的苦战。拓也通过感受自己身为数码兽的力量，在自然现象的帮助下，成功救出的同伴。
登场数码兽
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术士兽
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大嘴鸟兽
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鲜虾汉堡兽
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比特兽
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小火焰兽
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汉堡兽
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汉堡兽（成熟期）
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炸鸡球兽
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变色龙兽
玫瑰明星，与智天使兽的决战！
水银兽的兽型斗士之魂形态十数兽出现，被拉进十数兽体内的拓也他们被分散在各个区域，不得不独自应战。友树、纯平和泉成功脱困，但辉二受到幽暗兽袭击陷入苦战。由于炽天使兽的数码蛋引发的奇迹，辉二进化成了贝奥武夫兽，结果双方不分胜负。辉二在与幽暗兽火拼的时候突然感觉到对方体内有个人类少年的影子。
另一方面，拓也在十数兽体内与水银兽对决。危机时刻，数码蛋再次引发的奇迹让拓也进化成了阿尔达兽。在打倒水银兽后，在同伴齐心协力下成功击破了十数兽。
还在与贝奥武夫兽战斗的幽暗兽用智天使兽给予的兽型斗士之魂进化成了瓦尔格兽。在暗之力增大的过程中，他想起了自己是辉二的双胞胎哥哥辉一。要与自己的哥哥战斗辉二陷入了迷茫，但被拓也推了一把后终于击破了瓦尔格兽，辉一变回了人类形态。辉一完全恢复了记忆，通过与辉二的纽带，进化成了全新的暗之斗士黑狮兽。
加上辉一的一行人来到玫瑰明星，面临与智天使兽的直接对决。智天使兽的虽然力量强大，但被囚禁的座天使兽使用最后的力量将孩子们的数码器进化。拓也和辉二集结斗士之魂分别进化成了恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽，激斗过后击破了智天使兽，然而……
登场数码兽
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火山兽
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乌鸦天狗兽
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阿修罗兽
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蜜蜂兽
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白狮兽
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黑炽天使兽
皇家骑士出现！数码世界最大的危机
虽然打败了智天使兽，但数码世界仍然是一副被蚕食的模样。在遇到巴隆兽后，拓也他们得知过去被十斗士封印光明兽是灌输智天使兽邪恶之心的元凶。而效忠光明兽的皇家骑士君主兽和领主骑士兽突然出现，拓也和辉二虽然进化成恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽应对。但完全不是他们的对手，孩子们击飞到月球上去。
借助明星兽和汉堡兽的力量，拓也他们总算从月球返回，但皇家骑士已经开始动真格地抢夺各地的数据。虽然一行人为守护各地而战，但能力有限只能眼睁睁看着大地不断消失。另一方面，数码蛋孵化的创始村、波高兽他们的故乡炎之终端、炽天使兽城堡所在的森林地区、以秋叶市场为首的冰之地区的数据都被一一夺走。
最后残留的一块大地是座天使兽城堡所在的光之地区。为了死守这里，拓也他们全力以赴应对皇家骑士的挑战。但是突然从地底黑暗区域放出的能量将恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽打倒，皇家骑士趁机抢夺了光之区域的数码代码。
黑暗区域吸收了全部的大地数据，光明兽最终复活了。光明兽宣布要在毁灭的数码世界基础上创造一个只属于自己的全新数码世界。
登场数码兽
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巨星兽
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射手兽
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天鹅兽
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斩伐兽
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光明兽
十斗士的力量合而为一！与光明兽的决战
面对光明兽过于强大的力量，拓也他们败下阵来，暂且撤退到月球。在那里有之前从创始村到此避难的数码蛋和刚刚孵化出来的幼年期数码兽宝宝。面对还有守护的东西，拓也他们重新下定决心要战斗下去。面对皇家骑士的来袭也毫不动摇，恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽终于打败了他们。
但是，光明兽突然出现在现场，他抢先吸收了两位皇家骑士的数据随后就进化成了完全体的堕落形态。堕落形态的光明兽力量极大，恺撒暴龙兽和玛格纳加鲁鲁兽简直就像单方面的压制一样被打倒。
光明兽企图更是征服人类世界，他从黑暗区域打开了通往人类世界的通道。为了阻止光明兽的野心，拓也他们前往了黑暗区域。但在兼具光暗之力的光明兽面前，他们的任何攻击都显得苍白无力。辉一认为将自己的暗之力与辉二的光之力合而为一，或许能对抗光明兽，在将暗之斗士之魂托付给辉二后就消失了。辉一认识到在至今的战斗中自己都没有肉体，只是灵魂般的存在。
接受了辉一的心愿，十斗士的斗士之魂完全合而为一，拓也和辉二进化成了须佐之男兽，终于击破光明兽。然而光明兽的数据并没有被完全净化，其邪恶数据暴走，成为撒旦形态朝着人类世界前进。拓也他们追在后面，最后一战一触即发。
登场数码兽
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光明兽：堕落形态
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光明兽：撒旦形态
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光明兽：幼虫